Nazwa tej miejscowości sprawia trudności językoznawcom. Wywodzą ją od słowa "brzeginie", oznaczającego kiedyś brzeg.

Miejscowość powstała w połowie XIX wieku. Według danych ze Słownika Geograficznego Królestwa Polskiego z 1880 roku była to wieś w parafii Unieck. Liczyła 18 domów, 78 mieszkańców i 300 mórg ziemi, mieszkała tu drobna szlachta.

W 1921 roku naliczono 11 domów i 99 mieszkańców. Breginie należało do gminy Ratowo.